本题题干要求回答的“做法不正确的是”，因此，答题时应注意，对这种题型需要逐项分析。其中选项A为自行招标，则应理解自行招标的含义。招标人如具有编制招标文件和组织评标能力，可向有关行政监督部门进行备案后，自行办理招标事宜。而选项B是关于招标方式的内容，现行《中华人民共和国招标投标法》规定招标方式为公开招标和邀请招标两类。只有不属于法规规定必须招标的项目才可以采用直接委托方式。选项C是关于阶段招标承包的内容，根据阶段招标承包的要求，可以将矿业工程项目某些阶段或某一阶段的工作分别招标承包给若干单位。如把矿井建设分为可行性研究、勘察设计、施工、培训等几个阶段分别进行招标承包。这是目前多数项目采用的承包方式。
由此可见，只有选项D是不正确的，因此，本题答案为D。