自行协商适用于解决大多数专利纠纷，但不适用于专利行政纠纷。行政救济途径的启动可以由当事人提出申请，也可以由专利行政管理部门依职权启动。司法途径适用于解决所有类型的专利纠纷，具有权威性、公正性等优点，但也有成本高、周期长、举证难等缺点和难点。因此，司法途径并不一定是最佳解决途径。选择仲裁途径解决纠纷，需要当事人之间签署仲裁协议。仲裁协议有两种形式：一种是在纠纷发生之前订立的，通常以合同中的仲裁条款出现；另一种是在纠纷发生之后订立的，以便把已经发生的纠纷提交仲裁。