安全专项施工方案应由施工单位技术部门组织本单位施工技术，安全，质量等部门的专业技术人员进行审核。A选项正确；实行施工总承包的，专项施工方案应当由施工总承包单位组织编制，B选项正确；要由总监理工程师审查签字。C选项错误；对于超危大工程，施工单位应当组织召开专家论证会对专项施工方案进行论证，D选项正确；专项施工方案经论证不通过的，施工单位修改后应当按要求重新组织专家论证，E选项正确。