乳腺腺样囊性癌在形态上与唾液腺样囊性癌相似。镜下瘤组织细胞形态呈多种多样，主要包括三种类型：①基底样细胞，通常胞质较少，细胞核呈圆形和卵圆形，含有1-2个核仁；②内衬于真性腺腔的腺上皮细胞，常含有嗜酸性胞质，细胞核呈圆形，有时可见小核仁，核质较基地样细胞大；③位于基底样细胞周围，超微结构显示其为肌上皮细胞，细胞小而一致，卵圆形或短梭形，细胞质少，淡染，胞质呈嗜双色性或透亮，核大小一致，有时可见明显小核仁。Alcian蓝染色阳性，PAS染色阴性。癌细胞集成大小不等的圆形或卵圆形腔隙，即所谓圆柱形。