辅助因子包括小分子有机化合物和金属离子。小分子有机化合物是一些化学稳定的小分子物质，常含维生素或维生素类物质。分为：①辅酶：与酶蛋白以非共价键疏松结合，可用透析等简单方法分离；②辅基：与酶蛋白以共价键牢固结合，不能用透析等简单方法分离。主要作用：参与酶的催化过程，在反应中传递电子、质子或一些基团。金属离子多为酶的辅基。常见的有K+、Na+、Mg2+等。