抗甲状腺药物的不良反应有粒细胞减少、皮疹皮肤瘙痒、中毒性肝病和血管炎等。粒细胞缺乏是最严重的不良反应，可发生在服药的任何时间，表现为发热咽痛、全身不适等，严重者可出现菌血症或脓毒症，甚至死亡。治疗中应定期复查血象，如白细胞<3.0×109/L或中性粒细胞<1.5×109/L应停药，并遵医嘱给予促进白细胞增生药。