吗啡在肝脏代谢为吗啡-6-葡糖苷酸，它比吗啡更有效并且半衰期更长，从而引起额外的镇痛作用。吗啡也能代谢为吗啡-3-葡糖苷酸，它引起不良反应并且参照其他的代谢产物它是没有作用的。　　肾功能不全能产生吗啡-6-葡糖苷酸的积聚，具有后续阿片类效应包括呼吸抑制，所以在肾功能不全时慎用吗啡。　　肝功能不全的患者能耐受吗啡（甚至在肝昏迷前期），因为葡糖苷酸极少被破坏。　　短肠综合征，呕吐和腹泻限制了控释吗啡的效应，由于胃肠道吸收慢。