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在病毒感染中，病毒的包膜抗原和衣壳抗原均可刺激机体产生免疫应答，包括抗病毒免疫和免疫病理，后者常导致组织损伤。

体液免疫病理作用：当受感染的细胞表面存在病毒抗原时，可与体液中相应的抗体形成抗原-抗体复合物，产II型超敏反应，引发组织细胞损伤。

细胞免疫病理作用：抗病毒免疫以细胞免疫为主，细胞免疫在发挥其抗病毒感染的同时，特异性细胞毒性T细胞(CTL)等，也对宿主细胞产生损伤，引起类似于胞内菌(如分枝杆菌)感染的Ⅳ型超敏反应。

抑制免疫系统功能：直接杀伤免疫活性细胞;引起免疫抑制;引发自身免疫病。